martes, 7 de octubre de 2014

XV Ciencia en Acción. Barcelona 3-5 Octubre 2014

Señores, qué mayores nos hemos hecho. Vaya Congreso en Barcelona. Si el pasado de Bilbao fue impresionante ¡qué decir de éste! Habrá tenido la culpa la sesión científica de 5 horas de AVE. Creo que llegasteis a conocer el proyecto casi mejor que yo.
Porque, aunque todos tuvimos tiempo de visitar una parte del congreso en los otros stands, algo en el salón de actos, algo del museo CosmoCaixa, lo mejor, sin duda, fue nuestro taller. Y dentro de nuestro taller, probablemente nuestra comunicación fue de las que generó más bocas abiertas.
Creo que para no haber llevado el póster original no ha sido un mal congreso (es broma). Nadie nos hizo mención a vaya "porra" de póster; así que salimos más que airosos de ese desliz. Nunca la ausencia de un póster tuvo tan poca importancia (sé lo que me digo).
Bueno, pues esto es un congreso científico; los normales son un poco más aburridos, pero es que esto es Ciencia en Acción.
La labor queda bien hecha.
Enhorabuena a todos; hemos contribuido a un Gran Proyecto. No será fácil de olvidar.
Participantes en el proyecto Cómo mutan los genes junto a su investigador Fracisco Martínez-Abarca.
Nuestro stand.

Explicando a los visitantes el trabajo desarrollado.
Los asistentes atienden a nuestra exposición.
Participantes PIIISA en Ciencia en Acción junto a sus investigadores Francisco Martínez-Abarca y Javier Cáceres.
Francisco Martínez-Abarca
Investigador responsable de "Cómo mutan los genes".



viernes, 18 de julio de 2014

La EEZ en Ciencia en Acción

Hola a todos:
En la web de la Estación Experimental del Zaidín (http://www.eez.csic.es/) ya se ha hecho hueco de la noticia del premio para Ciencia en Acción. Lo podéis ver en el siguiente enlace (http://www.eez.csic.es/?q=es/node/7078). Otro de los proyectos también ha sido galardonado, el que lleva por título  "Extractos de plantas para bloquear la formación de biopelículas bacterianas".
¡¡¡Enhorabuena de nuevo!!!



Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008. Granada. Spain.

jueves, 3 de julio de 2014

De nuevo finalistas en Ciencia en Acción

¡¡¡ENHORABUENIIIIIIIISIMA!!!.
Señores, Barcelona (3-5 de Octubre) nos espera.
Somos uno de los quince proyectos de la MODALIDAD “LABORATORIO DE BIOLOGÍA” que se presentaran en Barcelona este Otoño. Lo podéis ver pulsando en este enlace.
Creo que nos llega en el mejor momento.
-Ya sabemos lo que hemos hecho; sabemos que es algo IMPORTANTE; sabemos cómo lo debemos de exponer!!!
-Pero como todo, nuevos retos se plantean.
-Queremos más!!.
-Debemos dejar huella.
-De momento se me ocurren nuevas ideas con las que convencer a todo el que nos vea lo magnífico que ha sido nuestro proyecto.
Tendremos tiempo de ponerlas en práctica y pensarlas a mediados o finales de septiembre.
Viva el 2e PIIISA-Team!!!!.
We got it!!!

No dejéis de estar atentos al whatsapp!!!!

Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008 Granada

lunes, 2 de junio de 2014

PIIISA en Con Ciencia

Hola a todos:
Esta mañana, Domingo 1 de Junio, han puesto en canal sur un programa dedicado al PIIISA que podeis ver en el siguiente enlace: http://alacarta.canalsur.es/television/programa/con--ciencia/265
Un premio al que me diga en que momento sale una referencia a nuestro proyecto (usad el apartado comentario en el blog). Pista, solo nosotros nos daremos cuenta.
Un saludo y escucharlo, os sentireis reflejados en mucho de lo que ahi se cuenta.

Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008 Granada Spain
Phone:+34 958 181600 ext. 311
Fax: +34 958129600"

viernes, 23 de mayo de 2014

IV Congreso PIIISA

Señores, ya sabemos lo que es un señor Congreso.
Me gustaría que analizáramos observando las distintas fotos lo que nos pasó el pasado Jueves 22 de Mayo. Esto que pudimos experimentar no es otra cosa que la fiesta de un gran congreso Científico. Donde se aportan ideas, se cargan las pilas, se conoce a grupos distintos, distintos enfoques e investigaciones. En resumen se interacciona con toda una comunidad científica (en este caso PIIISA). Como pudisteis comprobar tiene sus semejanzas y sus enormes diferencias con el Minicongreso EEZ-CSIC. Pero, ambos son necesarios:
Distintas gafas sobre un mismo objetivo.
¡Felíz final de curso y aún más, feliz verano!
 

 

 
No os desconectéis del todo, Ciencia en Acción se resuelve en julio...
Aupa super team 2e!!!
Enhorabuena a todos, vosotros, vuestros padres y a vuestros profesores.
 
Paco
 
Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008 Granada // Spain “

lunes, 12 de mayo de 2014

Ya estamos en los medios

Como nos avisó el jueves pasado Javier Cáceres, los proyectos PIIISA ya están en los medios, y como no podía ser de otro modo, el nuestro es de los destacados. Comentemos la noticia con nuestros más allegados.
Hip, Hip, Hurra!!!!
 

Dr Francisco Martinez-Abarca
Estacion Experimental del Zaidin - CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda n 1
18008
Granada
Spain

viernes, 9 de mayo de 2014

¡¡¡Qué bien lo hicimos!!!

Para ser nuestro primer congreso, la nota es de matrícula y alta. Señores... ¡qué nivel!. Incluso las respuestas a las preguntas de la sala fueron más que apropiadas. Pudísteis ver las distintas comunicaciones y lo buenas que fueron. Realmente para quitarse el sombrero.



 Ya los nervios superados, lo que queda a partir de ahora es disfrutar. El 22 de mayo nos veremos... Aunque quizá antes ¿no? No lo descartaremos por si hubiera que preparar algo.
¡¡¡Hip, Hip, Hurra!!!



Francisco Martínez-Abarca
Dpto de Microbiología y Sistemas Simbióticos
EEZ-CSIC
Granada

martes, 6 de mayo de 2014

¡¡¡Preparados, no. Sobradamente preparados!!!

Bueno, señores, tras el último ensayo, creo que estamos razonablemente preparados para demostrar en cualquier foro lo que hemos hecho y hasta donde hemos llegado. Como llevamos diciendo desde nuestro comienzo, allá por el 8 de enero, nos queda la guinda. Tras ajustar tiempos, diapositivas y charlas, lo vamos a hace de la siguiente manera:
Empezará José Luis, continuará Miguel, y los que queden leerán las conclusiones, en principio, en el siguiente orden: Teresa, María José y Marina (las dos últimas si Paula finalmente no viene).
Todos debemos echarle un vistazo a todo por si debemos resolver "imponderables" de última hora. Os quiero con la adrenalina justa, ¡ni más ni menos!.
Las conclusiones finales de nuestro trabajo son:

CONCLUSIONS
1. Sinorhizobium meliloti is a soil bacteria which easily change from mucoid to non-mucoid phenotype in laboratory culture.
2. S. meliloti GR4 strain shows more frequently non-mucoid variants than AK21 and RMO17 strains.
3. Single mutations T337 and T565 present in the expR gene of the mutants Gr4-5.1.1 and GR4-6.3.1 respectively affect deeply the expR gene and probably explain the non-mucoid phenotype.
4. ExpR gene is a good candidate to analyze the mucoid and non-mucoid phenotypes.

martes, 22 de abril de 2014

En la recta final

Hola a todos:
Tras la última sesión, las directrices del trabajo ya están expuestas. Como primera premisa ya tenemos el título de nuestro trabajo:
"Single mutations in a unique gene explain the non-mucoid phenotype in a soil bacteria", del que se derivan las siguientes conclusiones:

1. Sinorhizobium meliloti is a soil bacteria which easily change from mucoid to non-mucoid phenotype in laboratory culture.
2. S. meliloti GR4 strain shows more frequently non-mucoid variants than AK21 and RMO17 strains.
3. ExpR gene is a good candidate to analyze the mucoid and non mucoid phenotypes.
4. The single mutations T337 and T565 present in the gene ExpR of the mutants GR4-5.1.1. and GR4-6.3.1 respectively affect deeply the ExpR gene and probably explain the non-mucoid phenotype.


Para todo ello debemos desarrollar el manuscrito. Como tarea pendiente debemos asignar las leyendas a las siguientes figuras:
Figure 1. Sinorhizobium meliloti mucoid and non-mucoid phenotypes.

Figure 2. PCR, DNA electrophoresis...


Figure 3. Electropherograms showing the point mutations found.


Figure 4. Consequences of point mutations on ExpR gene.

Manos a la obra. Además de las personas asignadas deberíamos participar todos en todas dando nuestra opinión.
Hurry up!!!

Dr Francisco Martínez-Abarca
Estación Experimental del Zaidín -CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda nº 1
 
18008 Granada

viernes, 21 de marzo de 2014

El 19 de marzo de 2014: Una jornada difícil de olvidar

Hola a todos de nuevo.
Ayer miércoles experimentamos uno de los mejores momentos que tiene la investigación: EL DESCUBRIMIENTO. "La comprobación de que una hipótesis de partida ha sido acertada".
Además, Amparo Salido (técnico de secuenciación de la EEZ) nos enseñó el equipo que realizó la secuenciación de nuestros clones y nos mostró cómo surgieron esas secuencias.


Analizamos varias de las secuencias obtenidas de nuestros amplicones procedentes de muestras aisladas no mucosas y encontramos pequeñas diferencias (¿o no tan pequeñas? ver imagen). Analizando bien el significado de esa pequeña diferencia, el cambio de un solo nucleótido -de una G a una T-... ¡¡¡produce un cambio clave en la proteína ExpR!!!

Os recuerdo que analizamos, además del clon 5.1.1., una más, la 6.1.1. y encontramos una mutación parecida pero en otra coordenada del gen.
En estos días (mejor hoy que mañana) debemos de describr todas y cada una de las secuencias correspondientes al gen ExpR para todos los clones: 5.1.2, 6.3.1 y 6.4.2 y también en que consideramos ExpR wt, que se corresponden con las secuencias (2,4,5 y 6).
¡¡¡VENGA, QUE PODEMOS!!! 

Debemos tener todos los datos analizados e interpretados para el próximo día 2 de abril.
La comunicación, el póster y la presentación van a ser la GUINDA de este magnífico proyecto.
¡¡¡Nadie nos va a poder quitar esa satisfacción!!!
DESDE YA, enhorabuena por lo bien que lo estamos haciendo.
Hip, Hip, Hurra !!!
 

Dr Francisco Martínez-Abarca
Estación Experimental del Zaidín -CSIC
Department of Microbiology
C/ Profesor Albareda nº 1
18008 Granada